我院儿童保健科是集保健、科研、教学为一体的专业科室，是儿童心理卫生保健服务示范单位、儿童保健业务指导中心、儿童保健新技术培训中心、全国儿童死亡监测广东点、妇幼保健院重点专业科室、中国儿童铅中毒防治项目监测点、儿童营养及饮食行为试点门诊。承担着中山大学等七所高等院校的本科教学及临床教学；业务水平、专科建设、人力资源等方面在全国及全省儿童保健界均处于领先地位。现有专科医生14人，其中博士研究生1人，硕士研究生7人，高级职称6人，还有经验丰富高年资主治医生及主管护师多人。
      儿童保健科开展的专科包括：儿童早期发展专科、儿童生长发育专科、儿童营养与喂养指导专科、儿童心理行为专科、青少年保健（青春期保健）专科、儿童常见病预防专科，并设有铅中毒防治、中医保健、过敏性疾病预防、新生儿访视、高危儿随访和遗传代谢病随访等特色门诊；评估训练系统包括：自主研发的儿童心理行为评估与训练系统、儿童学习训练系统、感觉统合训练等。